Как построить филогенетическое древо в MEGA 11: Пошаговое руководство

• В видео объясняется, как построить филогенетическое древо из шестнадцати последовательностей рРНК любого бактериального изолята с помощью программного обеспечения Mega.  

• Для этого нужно загрузить последовательность гена рРНК в банк генов и создать файл блокнота с последовательностями.  

• Затем файл блокнота преобразуется в файл fasta с помощью кнопки "Сохранить как" в программе Mega.  

• После этого последовательности импортируются в программу Mega для выравнивания и построения филогенетического древа.  

• В программе Mega выполняется выравнивание последовательностей и построение филогенетического древа с использованием метода начальной загрузки.  

• В результате получается филогенетическое древо с внешней группой, которая может быть выбрана пользователем.  

• В видео рассказывается о том, как создать филогенетическое дерево с помощью программного обеспечения Mega.  

• Упоминается, что для построения дерева можно использовать различные варианты, включая традиционные и изогнутые ветви.  

• Автор подчеркивает, что для построения филогенетического дерева необходимо использовать последовательности штаммов определенного типа, а не случайные файлы или последовательности из шестнадцати РНК.  

• Он рекомендует использовать последовательности, полученные из типовых штаммов, депонированных в ATCC.  

• В следующем видео автор обещает показать, как извлекать последовательности из ATCC для любых бактерий, с которыми вы работаете.